РАЗРАБОТКА МОЛЕКУЛЯРНОЙ КОНСТРУКЦИИ ВАКЦИНЫ ПРОТИВ COVID-19 МЕТОДОМ ИММУНОИНФОРМАТИКИ И ОБРАТНОЙ ВАКЦИНОЛОГИЕЙ
- Мухамадиева З.Б., Мухамадиев Б.Т., Касимова Ш.А., Мухамадиева Н.Б.
1-Бухарский Инженерно-Технологический институт, Республика Узбекистан, г. Бухара; 2-Ташкентский фармацевтический медицинский институт, Республика Узбекистан, г. Ташкент; 3- Бухарский государственный медицинский институт, Республика Узбекистан, г. Бухара
Abstract
Актуальность. Пандемия COVID-19 стала глобальной проблемой вызвавшей озабоченность мирового научного сообщества разработкой и созданием контрмер против этого смертельного врага человечества. В настоящее время пандемия привела к гибели миллиона людей в результате инфицирования и распространения. Пока ещё не существует эффективной вакцины, которая была в состоянии бороться данной инфекцией, не смотря на то, что многие учёные из крупнейших научных центров (Китай, Россия, США, Узбекистан и др.) интенсивно работают над этой проблемой. С учётом этого мы провели собственные исследования по разработке возможных субъединичных вакцин на основе эпитопов против вируса COVID-19 с применением обратной вакцинологии, ферментного ингибирования и иммуноинформатики. Цель: создать новую конструкцию вакцины на основе эпитопа 4 белков COVID-19. Материалы и методы были использованы, получены и адаптированы в ходе экспериментов для разработки потенциальных вакцин против COVID-19 [6]. Самоидентификация вирусов, отбор и поиск последовательностей вирусных белков проводились с использованием базы данных NCBI. нуклеокапсидный фосфопротеин; гликопротеиновая мембрана; поверхностные гликопротеины; белок ORF3a. Заключение. В результате интенсивных вычислительных экспериментов и моделирования стало возможным создать три возможных дизайна вакцины (HA, GL, RT), и один из этих дизайнов был выбран как лучший вариант на основе исследования молекулярных настроек, который был бы эффективным. Результаты нашего исследования должны поддержать усилия ученых по принятию профилактических мер против вируса COVID-19.
Keywords
COVID-19, вакцина, иммуноинформатика, моделирова-ние, молекулярная нагрузка.
Literature
Huang C. et al /2020.”Clinical features patients infected wit 2019 novel coronavirus in Wuhen , China”,The Lancet 395, February (10223).497-506
Fattaeva D. R., Rizaev J. A., Rakhimova D. A. Efficiency of Different Modes of Therapy for Higher Sinus after COVID-19 in Chronic Obstructive Pulmonary Disease // Annals of the Romanian Society for Cell Biology. – 2021. – С. 6378–6383-6378–6383.
Su S. et al. 2016 “Epidemiology genetic recombination, and pathogenesis of coronaviruses”, Trends Microbiol 24,(June 6) 490-509, 2020
B. Sarkor et.al “Immunoinformatics guided designing of epitope-based subunit vaccines against the SARS Coronavirus-2 (SARS- COV-2)”
Chong D.C. khan A.M., 2019 “Vaccine Target Dis coverg” http el/doi.org/10,1016/ 978 0-12 809633-8 20100-3
Mukhamadiev B.T. “The effect of Nutritional additives of Clyceyzrizic aced, Glabridin and Resveratrol on SARS-coronavirus replication” J. Clinical Medicine Research (CMR, New York, 2020
Ullah M.A. et al. 2020 “Exploiting the rewerse vaccinology approach to design novel subcrit vaccine against ebola virus. medRxiv. https//doi org./101016/ j.imbcon, 2020 151949/
Vita R. et al. 2018 “The immune epitope database (I.E.D.B): 2018 update” Nuclei Acid. Res (47), 0339-343 https//doi.org/10 1093/nar/gky 1006
Wu C.Y. et al. 2010 “Improving therapeutic HPY repid-based vaccine Sci, 17(88 ), 2010potency by euhuncing CD4+r help and dendritic cell activation”. J. Biomed.
Kallbug M/ et al “Template – based protein structure modeling using the raptor X web server” Nat protocol. 7, 1511 http//doi. Org/101016/ npror. 2012, 085
Zobaer M. 2018. “Jn Silico characterization and Homology Modelling of Histamine Recceptors (Doct. dis)” Khulna Univ Eng. Thechu., Bangladesh. https//doi org./ 103923/jbs 2018. 178.19)
Solanski V. Tiwari V. 2018 “Subtraction proteomics to identify novel drug targets and reversy against Acienetobacter bank” Sci. Rep. 8, 9044. https//doi.org. 101038/341598-018-26689-7
Taweris M.D et al 2003. “Safety and efsicacy of MVA85A, a new tuberculosis vaccine in infonts” The Lancet, 381, 1021-1028. https//doi.org/10.1016/5 01 40-6736 (13) 60177-4
Hassow S.S. et al. 2015 “The past, current and future trends in DNA vaccine imminisation Acian Pac.J. Trop Riomed. 5, 344-353. https//doi.org/101016/3 2211-1691 (15) 30366-x.
Kaufmann S.H. et al. 2014 “Challenges and responses in human vaccine development” Curr. Opin. Immunol, 28,18-26, https://doi.org./ 101016/coi 2014.01
Craig D.B. 2013. “Disulfide by Design 2.0: web based tool for disulfide engineering in proteins” BMC Bioinformatics 14(346)/ https//doi .org/101186/ 1471-2105-14-34
Chauhan V. et al. 2019 “Designing a multiepitope based vaccine to combat Kaposi Sarcoma utilizing immunoinformatics approach” Sci. Rep. 9, 1-5 https:// doi org. /101038/3 41598-019-39299-8
Cano R.I., Lopera H.D., 2013 “Introduction to T- and B lymphocytes. Autoimmunity From Bench to Bedside”. EI Rosario University Press
Mukhamadiev B.T. et al “Electromagnetic field of low frequency and communication systems in microorganisms”, The Lancet , (In Press)
NCBI https:// www.iedb.nlm.nih.gov/
MHC cluster https://www.cbs.dti.dk/services/ MHC cluster/
https://services .mbi ucla .edu/PROCHEK/
I MODS (http://imods.chaconlab.org
https//www.ede.gov/cjujnavirus/2019-ncov/ about/ transvissions. Html
https:// en.wikipedia.org/wiki/coronavirus
https://www.iedb.org/ IEDB
- Pushlish date: 10.11.2022
- DOI:
- Release: 5 ( 2022 ). Problems of biology and medicine
- Section: Experimental studies
-
Цитирование:
Мухамадиева З.Б., Мухамадиев Б.Т., Касимова Ш.А., Мухамадиева Н.Б. РАЗРАБОТКА МОЛЕКУЛЯРНОЙ КОНСТРУКЦИИ ВАКЦИНЫ ПРОТИВ COVID-19 МЕТОДОМ ИММУНОИНФОРМАТИКИ И ОБРАТНОЙ ВАКЦИНОЛОГИЕЙ// Проблемы биологии и медицины. - 2022. №5. Том. 139. - С. 271-277. DOI: http://doi.org/ -
Копировать
Авторы, публикующиеся в журнале «Проблемы биологии и медицины», соглашаются со следующими условиями:
а. Авторы оставляют за собой право на авторство своей работы и передают журналу право первой публикации этой работы на условиях лицензии, которая позволяет другим лицам свободно распространять опубликованную работу с обязательной ссылкой на авторов оригинальной работы и на первую публикацию работы в этом журнале.
б. Авторы имеют право подписывать самостоятельные дополнительные соглашения относительно не эксклюзивного распространения работы в том виде, в котором она была опубликована этим журналом (например, размещать работу в электронном хранилище учреждения или публиковать в составе монографии), при условии сохранения ссылки на первую публикацию работы в этом журнале.
в. Политика журнала позволяет и поощряет размещение авторами в сети Интернет (например, в хранилищах учреждений или на личных веб-сайтах) рукописи работы как до подачи этой рукописи в редакцию, так и во время редакционной обработки, так как это сопутствует возникновению продуктивной научной дискуссии и положительно сказывается на оперативности и динамике цитирования опубликованной работы (см. The Effect of Open Access).