• Секлер Д.Э., Таджиев Б.М., Тойчиев А.Х.
  Республиканский специализированный научно-практический медицинский центр эпидемиологии, микробиологии, инфекционных и паразитарных заболеваний министерства здравоохранения Рес-публики Узбекистан, г. Ташкент

Abstract

Актуальность: Изучение генетических факторов человека играет важную роль в предопределении развтия заболевания при ВИЧ инфекции. Некоторые исследования выявили однонуклеотидные полиморфизмы в области генов PRMT6 и SOX5, связанные с развитием заболевания. В нашей стране такие исследования провоились впервые. Цель: изучение полиморфизма SNPs rs4118325, в локусе гена PRMT6, и rs1522232 в регионе гена SOX5 среди пациентов с ВИЧ/СПИД в узбекской популяции. Материал и методы: в исследовании приняли участие 50 человек с быстрой прогрессией ВИЧ/СПИД, 50 человек с медленным развитием заболевания и 50 ВИЧ-негативных лиц. SNP-генотипирование проводилось методом ПЦР TakMan Probe. Результаты: результаты наших исследований показали высокую значимость двух исследованных однонуклеотидных мутаций SNPs rs4118325, в локусе гена PRMT6, и rs1522232 в регионе гена SOX5, продемонстрировав высокую ассоциацию данных полиморфизмов с быстрой прогрессией заболевания ВИЧ/СПИД (p=0.0003; χ² тест: 16.09). Выводы: Установлено, что аллели rs4118325/G (ген PRMT6), rs1522232 /C (ген SOX5) могут быть использованы в качестве прогностических маркеров быстрой прогрессии ВИЧ/СПИД в узбекской популяции

Keywords

SNP, ВИЧ/СПИД, быстрая прогрессия ВИЧ/СПИД, rs4118325, PRMT6, rs1522232, SOX5

Literature

1.    Хаитов Р.М., Алексеев Л.П., Гудима Г.О., Кофиади И.А. Аллельные варианты генов человека, затрагивающие внутриклеточный жизненный цикл ВИЧ и регулирующие иммунный ответ на ВИЧ-инфекцию. // Бюллетень сибирской медицины. 2019; 18 (1): 119–130

2.    Evangelou, E.; Fellay, J.; Colombo, S.; Martinez−Picado, J.; Obel, N.; Goldstein, D.B.; Telenti, A.; Ioannidis, J.P. Impact of phenotype definition on genome−wide association signals, empirical evaluation in human immunodeficiency virus type 1 infection. // Am J Epidemiol 2011, 173, 1336−1342.

3.    Fellay, J.; Ge, D.; Shianna, K.V.; Colombo, S.; Ledergerber, B.; Cirulli, E.T.; Urban, T.J.; Zhang, K.; Gumbs, C.; Smith, J.P.; et al. Common genetic variation and the control of HIV−1 in humans. // PLoS Genet 2009, 5, e1000791.

4.    Guergnon, J.; Theodorou, I. What did we learn on host's genetics by studying large cohorts of HIV−1−infected patients in the genome−wide association era? // Current Opinion in HIV and AIDS 2011, 6, 290−296.

5.    Herbeck, J.T.; Muller, V.; Maust, B.S. et al. Is the virulence of HIV changing? A meta−analysis of trends in prognostic markers of HIV disease progression and transmission. // AIDS 2012, 26, 193−205.

6.    Kouri V, Khouri R, Alemán Y, et al. CRF19_cpx is an Evolutionary fit HIV-1 Variant Strongly Associated with Rapid Progression to AIDS in Cuba. // EBioMedicine. 2015 Jan 28;2(3):244-54. doi: 10.1016/j.ebiom.2015.01.015. PMID: 26137563; PMCID: PMC4484819.

7.    Kwok, P.Y., et al. 2000. Single nucleotide polymorphism (SNP): genetic marker of the new millennium? // Gene Med. 4:37-43.

8.    Le Clerc S, Limou S, Coulonges C, Carpentier W, et. al. Genomewide association study of a rapid progression cohort identifies new susceptibility alleles for AIDS (ANRS Genomewide Association Study 03). // J Infect Dis. 2009; 200(8):1194-201. doi: 10.1086/605892. PMID: 19754311.

9.    Le Clerc S, Limou S, Zagury JF. Large-Scale "OMICS" Studies to Explore the Physiopatholgy of HIV-1 Infection. // Front Genet. 2019 Sep 13;10:799. doi: 10.3389/fgene.2019.00799. PMID: 31572435; PMCID: PMC6754074.

10. Lingappa, J.R.; Petrovski, S.; Kahle, E.; Fellay, J.; Shianna, K.; McElrath, M.J.; Thomas, K.K.; Baeten, J.M.; Celum, C.; Wald, A.; et al. Genomewide association study for determinants of HIV−1 acquisition and viral set point in HIV−1 serodiscordant couples with quantified virus exposure. // PLoS One 2011, 6, e28632.

11. Mellors, J.W.; Margolick, J.B.; Phair, J.P.; Rinaldo, C.R.; Detels, R.; Jacobson, L.P.; Muñoz, A. Prognostic value of HIV−1 RNA, CD4 cell count, and CD4 Cell count slope for progression to AIDS and death in untreated HIV−1 infection. JAMA 2007, 297, 2349−2350.

12. Naranbhai V, Carrington M. Host genetic variation and HIV disease: from mapping to mechanism. // Immunogenetics. 2017 Aug;69(8-9):489-498.

13. Tang, J.; Kaslow, R.A. The impact of host genetics on HIV infection and disease progression in the era of highly active antiretroviral therapy. // AIDS 2003,17, S51−S60