Сравнительная характеристика трех методов snp генотипирования гена ifnλ3 среди вгс инфицированных в Узбекистане
- Секлер Д.Э.
Научно-исследовательский институт вирусологии, МЗ РУз, г. Ташкент
Abstract
Актуальность. Противовирусная терапия при вирусном гепатите С остается главным методом предотвращения развития осложнений заболевания. Важным аспектом научных исследований становится возможность прогнозирования эффективности терапии, которая появилась с открытием единичных нуклеотидных полиморфизмов (SNP). Цель исследования: определение наиболее точных методов генотипирования для выявления полиморфизмов, связанных с геном IFNλ3. Материалы и методы: нами были протестированы два SNP тремя различными молекулярно-генетическими методами. В исследованиях были использованы 95 образцов от лиц, инфицированных вирусом гепатита С. Результаты. В результате тестирования все три метода показали одинаково высокую точность и полное совпадение результатов. Выводы: учитывая экономичность и доступность, рекомендуется использование ПЦР генотипирования TaqMan, для определения полиморфизма гена IFNλ3 в условиях Узбекистана.
Keywords
IFNλ3, SNP генотипирвание, ВГС.
Literature
Булатова И.А., Кривцов А.В., Щёкотова А.П., Ларионова Г.Г., Щёкотов В.В. взаимосвязь тяжести поражения печени с полиморфизмом гена интерлейкина 28B у больных хроническим гепатитом C // Фундаментальные исследования. – 2013. – № 12-2. – С. 186-190
Семенов С.И., Федоров А.И., Осаковскж В.Л., Максимова С.С., Платонов Ф.А. Частота встречаемости полиморфных вариантов гена il28b и генотипов вируса гепатита с у населения якутии: клинические исходы. // Журн. микробиол., 2017, № 2, С. 86-92.
Bruno S., et al. Peginterferon alfa-2b plus ribavirin for naïve patients with genotype 1 chronic hepatitis C: a randomized controlled trial. //J. Hepatol. 2004. 41:474-481.
Ge D., et al. Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatment induced viral clearance. //Nature 2009. 461:399–401.
Hadziyannis SJ, Sette H Jr, Morgan TR, et al.: Peginterferonalpha2a and ribavirin combination therapy in chronic hepatitis C: a randomized study of treatment duration and ribavirin dose. //Ann Intern Med 2004, 140:346–355.
Kurbanov, F., et al. Genetic Polymorphism in IL28B is associated with spontaneous clearance of hepatitis C virus genotype 4 infection in an egyptian cohort. //J. Inf. Dis. 2011. 204:1391-1394.
Kwok, P.Y., et al. Single nucleotide polymorphism (SNP): genetic marker of the new millennium? //Gene Med. 2000. 4:37-43.
McHutchison JG, Lawitz EJ, Shiffman ML, et al.: Peginterferon alfa-2b or alfa 2a with ribavirin for treatment of hepatitis C infection. //N Engl J Med 2009, 361:580–593.
Montes-Cano, M. A., et al. Interleukin-28B genetic variants and hepatitis virus infection by different viral genotypes. //Hepatology. 2010.52:33–37.
Rauch, A., et al. Genetic variation in IL28B is associated with chronic hepatitis C and treatment failure: a genome-wide association study. //Gastroenterology. 2010. 138:1338–1345.e7.
Suppiah, V., et al. IL28B is associated with response to chronic hepatitis C interferon-alpha and ribavirin therapy. //Nat. Genet. 2009. 41:1100–1104.
Tanaka, Y., et al. Genome-wide association of IL28B with response to pegylated interferon-alpha and ribavirin therapy for chronic hepatitis C. //Nat.Genet. 2009. 41:1105–1109.
Thomas, D.L., et alGenetic variation in IL 28B and spontaneous clearance of hepatitis C virus. //Nature. 2009. 461:798-801.
Younossi, Z., J. Kallman, and J. Kincaid. The effects of HCV infection and management on health-related quality of life. //Hepatology. 2007. 45:806–816.).
- Pushlish date: 12.11.2020
- DOI: 10.38096/2181-5674.2020.4.00203
- Release: 4 ( 2020 ). Problems of biology and medicine
- Section: Clinical studies
-
Цитирование:
Секлер Д.Э. Сравнительная характеристика трех методов snp генотипирования гена ifnλ3 среди вгс инфицированных в Узбекистане// Проблемы биологии и медицины. - 2020. №4. Том. 120. - С. 114-117. DOI: http://doi.org/10.38096/2181-5674.2020.4.00203 -
Копировать
Авторы, публикующиеся в журнале «Проблемы биологии и медицины», соглашаются со следующими условиями:
а. Авторы оставляют за собой право на авторство своей работы и передают журналу право первой публикации этой работы на условиях лицензии, которая позволяет другим лицам свободно распространять опубликованную работу с обязательной ссылкой на авторов оригинальной работы и на первую публикацию работы в этом журнале.
б. Авторы имеют право подписывать самостоятельные дополнительные соглашения относительно не эксклюзивного распространения работы в том виде, в котором она была опубликована этим журналом (например, размещать работу в электронном хранилище учреждения или публиковать в составе монографии), при условии сохранения ссылки на первую публикацию работы в этом журнале.
в. Политика журнала позволяет и поощряет размещение авторами в сети Интернет (например, в хранилищах учреждений или на личных веб-сайтах) рукописи работы как до подачи этой рукописи в редакцию, так и во время редакционной обработки, так как это сопутствует возникновению продуктивной научной дискуссии и положительно сказывается на оперативности и динамике цитирования опубликованной работы (см. The Effect of Open Access).